本所原隸屬北斗鎮公所戶籍課，行政院於民國58年5月15日臺(58)內字第3899號令頒「戡亂時期臺灣地區戶政改進辦法」，自民國58年7月1日起至62年3月11日止試辦戶警合一，將公所戶籍課撤銷，另設北斗鎮戶政事務所，置主任一人由鎮長兼任，副主任由警察副分局長兼任，業務受縣警察局指揮監督。

　　直到民國62年2月12日，行政院公佈修正「戡亂時期臺灣地區戶政改進辦法」，規定戶政事務所隸屬縣警察局，取消鎮長兼任主任改由副分局長擔任，戶政人員列入警察機關編制，民國62年7月17日修正公布戶籍法，正式成立彰化縣警察局北斗鎮戶政事務所，遷入北斗警察分局廳舍內辦公，座落於北斗鎮新政里光復路251號。

　　民國80年5月1日宣佈終止動員戡亂時期後，戶警合一失去法源依據，籌劃歸屬民政機關事宜。民國81年6月29日修正公佈戶籍法，明訂縣政府設戶政事務所，以鄉鎮為管轄區域，民國81年7月1日起正式隸屬縣政府，為彰化縣北斗鎮戶政事務所。民國81年10月4日戶政事務所新建辦公廳落成，當日遷入新址辦公，座落於北斗鎮新政里地政路466號，與彰化縣警察局北斗分局為鄰。

    民國108年7月22日起彰化縣北斗鎮、埤頭鄉、田尾鄉及溪州鄉戶政事務所正式整併為「彰化縣北斗戶政事務所」，以北斗為中心所，埤頭、田尾及溪州分設辦公室，服務據點不變、服務項目不減，用心便民不打折，並於8月3日起於中心所(北斗)開辦週六延長服務。